引起鼠疫的是一種很小的桿菌，名叫鼠疫桿菌。這種茵通過老鼠身上的跳蚤(鼠蚤)傳染給人類。跳蚤吸食鼠疫患者的血液后胃中充滿了鼠疫的桿菌，食道被細菌阻塞。它們雖是鼠蚤，但有時亦咬人。這種帶菌的跳蚤吸入血時血液因食道被細菌阻塞無法入胃而從口部回流到被咬人的身體里，鼠疫細菌就在這時隨同進入人體，使人患上鼠疫。跳蚤在吸食人血時還可能把糞便排在人的皮膚上，其中也合有大量鼠疫細菌。因為被咬部位發癢，搔癢時會將鼠疫細菌帶入微細的傷口，也能使人染上鼠疫。